医学影像科是本院重点发展科室之一，2007年在北京同仁医院放射科、东南大学附属中大医院放射科援建下成立。其中一期建筑面积 2271 平方米，年检查量约25人次。近年来以学科建设为导向，2014 年成为南京市医学重点专科，已连续举办9期江苏省继续教育培训班“头颈影像诊断与临床治疗”。

科室人才梯队完备，现有医技护队伍53人，其中高级职称9人，中级职称18人；科室设备齐全，拥有美国GE公司256排超高端螺旋CT（Revolution CT）、德国西门子公司3.0T磁共振（MAGNETOM Skyra）及断层乳腺DR（MAMMOMAT Inspiration）等大型医疗设备。2024年引进江苏省首台双源双探超高分辨力骨质专精CT（LARGEV-Ultra3D），眼耳鼻喉及四肢小关节骨质高清CT显示分辨力达10微米级，该项检查填补了省内空白，并居于省内领先地位。科室下设头颈、骨肌、心胸、腹部四个亚专业学组；按照江苏省三级综合医院标准，开展各项医学影像常规技术及重点技术。例如，颅脑CTA+CTP、胸痛三联CTA成像、心脏MRI检查及CT-FFR、乳腺DR断层成像等新技术。

科室秉承以头颈影像为特色，各亚专科医、教、研全面发展的学科建设方向，近年来在学科带头人车子刚主任带领下，依托东南大学、南京医科大学、首都医科大学、大连大学等多所高校，建立了教学及人才培养渠道；整体医、教、研水平稳步提升。2025年以第一或通讯作者发表SCI论文7篇，核心期刊论文6篇，中华系列期刊3篇，立项省级课题2项，市级课题2项。2014年获市重点专科以来，参与或主持省、市、区、院级等各层次课题10余项，获南京市医学新技术引进奖3项，入选“十三五”南京市青年卫生人才1项等；多次承办或参与全国、省、市级学术交流活动等，包括中华医学会、中国医师协会、江苏省医学会、江苏省医师协会、南京医学会等学术活动，累及获优秀论文奖、优秀案例奖等20余人次。

科室目前是中华口腔医学会放射分会、中国医药教育协会影像技术专委会、中国医师协会医学影像对比剂与安全应用学组、中国医院协会神经头颈影像分会、中国远程医疗与信息协会、中国医学救援影像协会等委员单位，学科带头人同时兼任江苏省医学会放射分会头颈影像学组副组长、江苏省中西医结合学会头颈影像学组组长、江苏省社会办医疗机构协会放射分会骨肌组长、南京医学会放射分会委员兼人工智能学组副组长、南京卫健委基层医疗影像管理质控中心委员、南京老年医学会影像分会副主任委员等。

科室配备先进的影像互联网会诊中心，已加入国家卫健委慢性肝病及原发肝癌数据库、首都医科大学附属北京友谊医院超高分辨力CT联盟、东南大学附属中大医院影像联盟、南京鼓楼医院“鼓楼云”影像专科联盟等。联合全国各大医院及联盟机构，为更多的患者排忧解难；推出“一站式”影像全流程服务，可以为患者提供影像门诊挂号、咨询、检查、报告等全流程便捷服务。